Для исправления счёта-фактуры нужно использовать ту форму, которая была действительна при составлении первоначального документа.
Налоговая служба в своих разъяснениях
Исправлять недочёты, не мешающие определить покупателя, продавца, наименование товаров, работ, услуг, имущественных прав их стоимость и размер налога, не обязательно. Если эти реквизиты идентифицируются, то налоговики не могут отказать в вычете. Если же такие ошибки всё же решили исправить, что в этом случае исправленные счета-фактуры в книге продаж регистрировать не нужно.
Ранее разъяснялось, как оформлять документы при расхождениях в количестве товара.